फंगल संक्रमण अक्सर शरीर में स्वाभाविक रूप से मौजूद सूक्ष्मजीवों के एक साधारण असंतुलन से उत्पन्न होते हैं।

यह वास्तव में विभिन्न कवक और बैक्टीरिया की भीड़ द्वारा उपनिवेशित है, जो ज्यादातर समय हानिरहित और यहां तक ​​कि शरीर के समुचित कार्य के लिए आवश्यक है।

हालांकि, ऐसा हो सकता है कि इनमें से कुछ कवक फैलते हैं और रोगजनक बन जाते हैं, या यह कि एक "बाहरी" कवक, उदाहरण के लिए किसी जानवर द्वारा प्रेषित, संक्रमण का कारण बनता है। कवक की कुल 200-400 प्रजातियां मनुष्यों में रोग पैदा कर सकती हैं⁵.

हालांकि, पर्यावरण में मौजूद कवक भी इंसानों को दूषित कर सकते हैं, उदाहरण के लिए:

• टीका द्वारा, उदाहरण के लिए चोट के दौरान (स्पोरोट्रीकोसिस या क्रोमोमाइकोसिस, आदि के लिए अग्रणी);
• मोल्ड्स (हिस्टोप्लाज्मोसिस, एपरगिलोसिस, आदि) के साँस लेना द्वारा;
• एक संक्रमित व्यक्ति (कैंडिडिआसिस, दाद, आदि) के संपर्क से;
• संक्रमित जानवर के संपर्क में आने से।