RSI चॉकलेट एलर्जी संभव हैं भले ही वे हैं rares. इस मामले में एलर्जी की घटना कोको के प्रोटीन से आती है। इसके सेवन से एलर्जी करने वाले को सांस लेने में तकलीफ होती है, सिर दर्द, रैशेज, टैचीकार्डिया, खुजली और पेट में जलन होती है।

ये लक्षण उन लोगों में भी देखे जा सकते हैं जिन्हें चॉकलेट बनाने वाले तत्वों से एलर्जी है (नट, दूध प्रोटीन, आदि।।), भले ही वे वास्तव में कोको प्रति से एलर्जी नहीं हैं।