लक्षण के बीच प्रकट होते हैं संक्रमित कीट के काटने के 10 और 15 दिन बाद. कुछ प्रकार के मलेरिया परजीवी (प्लाज्मोडियम वाइवैक्स et प्लाज्मोडियम ओवले) पहले लक्षण दिखाई देने से पहले हफ्तों या महीनों तक जिगर में निष्क्रिय रह सकते हैं।

मलेरिया को आवर्तक हमलों की विशेषता है जिसमें तीन चरण शामिल हैं:

• ठंड लगना;
• सिरदर्द;
• थकान और मांसपेशियों में दर्द;
• मतली और उल्टी;
• दस्त (कभी-कभी)।

एक या दो घंटे बाद:

• तेज बुखार;
• त्वचा गर्म और शुष्क हो जाती है।

तब शरीर का तापमान गिरता है:

• विपुल पसीना;
• थकान और कमजोरी;
• प्रभावित व्यक्ति सो जाता है।

पी. विवैक्स और पी. ओवले मलेरिया संक्रमण पहले संक्रमण के कुछ हफ्तों या महीनों बाद भी फिर से हो सकता है, भले ही रोगी ने संक्रमण के क्षेत्र को छोड़ दिया हो। ये नए एपिसोड "निष्क्रिय" यकृत रूपों के कारण हैं।