चूंकि चिड़चिड़ा आंत्र सिंड्रोम के कारणों के बारे में बहुत कम जानकारी है, इसलिए इसे होने से रोकने का कोई तरीका नहीं है।

आहार परिवर्तन और बेहतर प्रबंधन तनाव असुविधा को कम कर सकता है (अनुभाग चिकित्सा उपचार देखें)।